Что значит вернуть компьютер в исходное состояние

это равносильно чистой установке операционной системы?
да
Или если вирусы/вредоносное ПО внедрились в систему, то функция «Вернуть компьютер в первоначальное состояние» их не удалит?
никто не может гарантировать, что 0-дай уязвимости вас не настигнут в любой позе, в любое время, в любом месте

ps разве что можно считать, что ресет системы достаточно сильно снижает вероятность повторного заражения для большинства угроз

Возврат к исходному состоянию это по факту автоматическая переустановка ОС из дистрибутива находящегося в разделе восстановления.
Выполняется в двух вариантах.


С сохранением файлов - просто переустановка без очистки диска.

Без сохранения файлов - переустановка с очисткой диска. Система ставится на чистый диск




Или если вирусы/вредоносное ПО внедрились в систему, то функция «Вернуть компьютер в первоначальное состояние» их не удалить?
При первом варианте - возможно не удалить, но сделает неактивными.
При втором варианте - удалить.

Вирусы и вредоносное ПО это обычное ПО. И работает это ПО только тогда когда его кто-то установить в систему или запустить. После переустановки ОС даже если это ПО останется на компьютере в виде файлов работать оно не будет. Пока его кто-нибудь не запустить.

С позиции "чистоты" ОС от зловредов установка заново и возврат в первоначальное состояние - пожалуй, да, равноценны (хотя есть и нюансы: защищённость вендорского и майкрософтовского дистрибутивов от заражения, ПМСМ, неодинакова, второй надёжнее).
А по получаемым результатам разница такая - при установке заново получается пустая ОС (совсем без ничего), а при возврате в первоначальное состояние получается, как правило, ОС, начинённая всякими вендорскими добавками. И большинство пользователей эти добавки потом вычищают.
Так что если вы действительно желаете чистую ОС, то правильнее установить из дистрибутива MS на отформатированный диск.